Regresa el pequeño grupo de estudiantes de Genshiken (Sociedad por el Estudio de la Cultura Visual Moderna), con esta nueva temporada; ahora con un nuevo Presidente:
Sasahara Kaji y con nuevos miembros. El grupo ha ganado su propia cabina de ventas en el próximo Comi-Fes, y participarán por primera vez como vendedores en vez de ser parte de la muchedumbre de la convención. Sasahara, combina los talentos de sus miembros y comienza a trabajar en el lanzamiento de su primer doujinshi. Se acerca la fecha límite, ¿lo lograrán a tiempo?